Program Studi Teknik Lingkungan merupakan program studi ke-13 yang berdiri di Institut Teknologi Kalimantan. Proses pendirian Program Studi Teknik Lingkungan dibantu oleh Dosen Program Studi Teknik Sipil di bawah arahan Dr. Ir. Elina Sitepu Pandebesie, M.T., yang kemudian dilanjutkan oleh 5 orang Dosen Program Studi Teknik Lingkungan yang diterima di ITK pada Januari 2016. Pengajuan program studi ini telah dilakukan sejak
bulan Maret 2016, sebelum akhirnya resmi terbentuk dengan ditandai penerbitan Keputusan Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi RI Nomor 285/KPT/I/2017 Tentang Izin Pembukaan Program Studi Teknik Lingkungan Program Sarjana pada Institut Teknologi Kalimantan pada tanggal 29 Mei 2017. Dengan terbitnya izin pendirian prodi, Program Studi Teknik Lingkungan melakukan proses penjaringan mahasiswa melalui Seleksi Mandiri tahun 2017. Melalui seleksi tersebut, secara resmi 10 mahasiswa angkatan pertama diterima pada Program Studi ini dibawah arahan Koordinator Program Studi
Teknik Lingkungan periode Juni – Agustus 2018, M. Ma’arij Harfadli, S.T., M.T. Selanjutnya sejak September 2018 hingga saat ini, posisi Koordinator Program Studi Teknik Lingkungan dipegang oleh Umi Sholikah, S.Si., M.T.